Vale a pena investir em empresa que gerou alguns anos de lucro liquido negativo, mas com fluxo de caixa positivo ?

Depende de cada caso. A Cyrela teve prejuízo em 2017 mas gerou mais caixa que em 2016, quando teve lucro. Geralmente é preciso avaliar o motivo de tal descasamento. Pode ser apenas questões contábeis ou a empresa está com um caixa que não irá lhe pertencer lá na frente. Empresas sólidas, contudo, costumam ter as duas métricas sempre positivas.

Alguns anos de lucro líquido negativo, significa um histórico de prejuízos para empresa, um investidor de valor investe em companhias que tenham histórico de lucros nos últimos anos e fluxo de caixa positivo; para garantir o pagamento de dividendos nos próximos anos.

Esse tipo de empresa da pergunta, eu não recomendo, por ser um tipo de operação especulativa.

Existem alguns casos que a empresa sofreu eventos não recorrentes e por isso acabou entregando prejuízo, porém sendo algo totalmente pontual e que não tende a se repetir. Pode também ocorrer da empresa ter sofrido com efeitos puramente contábeis em seus resultados (como Impairment, por exemplo), o que também não tem efeito caixa e não indica uma situação adversa necessariamente.

Quer um exemplo de empresa nessas condições? A Tupy. Em 2016, a empresa teve um grande prejuízo contábil, mas gerou muito caixa e pagou elevados dividendos.

A mensagem que fica é que o lucro líquido é importante, mas não deve ser avaliado isoladamente.