Fala, Gustavo!
Na análise de uma holding, acredito que o ideal é analisar as empresas que fazem parte da holding. Não precisa ser todas, mas as mais representativas no resultado da holding.
Exemplos: Itaúsa tem cerca de 90% do resultado vindo do Itaú, então você analisa o Itaú. Bradespar tem a maior parte de seu resultado vindo da Vale, portanto você analisa a Vale.
Depois é importante fazer o cálculo de desconto de holding, ou seja, saber se é mais viável comprar ações da holding ou das empresas de que ela participa diretamente.
Sobre o EBITDA, ele é um indicador operacional. Logo, não faria sentido usá-lo na análise de uma holding que não tem resultado operacional.
Espero ter ajudado.
Abraço!