Nas transferencias de corretagem, normalmente a corretoras utilizam o preço de fechamento de mercado do seu ativo, para definir seu preço medio; acontece que se seu preço medio é de 100 em um ativo, e na transferencia ele fecha em 85 a preço de mercado, por exemplo, isto pode aferta diretamente em algo na sua carteira?

Ficou um pouco confuso a sua pergunta, mas vou tentar responder. As corretoras costumam usar o preço de compra das cotas para calcular o preço médio, só que sem as taxas referêntes a compra dos ativos.

A cotação de fechamento é usada, normalmente, para calcular o rendimento do investimento subtraindo o preço atual do preço médio e tendo, assim, a rentabilidade da cota.

Se a sua dúvida for em relação ao primeiro parágrafo isso afeta sim sua carteira, pois ao retirar as taxas pagas na compra do ativo o seu preço médio fica menor do que realmente foi gasto para adquirir a cota.