Minha carteira está com rendimento de -12,41% referente ao IBOV. Sei que nem sempre é o benchmark ideal porém o que poderia explicar esse desempenho?

Eu não me preocuparia muito com isso se fosse você. Em períodos de crescimento acelerado do mercado, é natural que uma carteira individual fique abaixo do índice, pois é comum que nesse momento os maiores crescimentos venham de empresas especulativas, que não necessariamente fazem parte das carteiras de longo prazo em geral. O importante é continuar aportando em boas empresas e olhar em um horizonte mais longo.

De qualquer forma, é difícil falar com mais detalhes sem conhecer a carteira em si. Se você está incomodado, cabe fazer uma revisão das suas posições, especialmente aquelas que não desempenharam como esperado, para identificar se isso tem ocorrido apenas por variação natural do mercado ou se houve algum erro de análise antes do investimento ser realizado.